| Zkratka |
Ústav |
Pracoviště |
Biologický materiál |
Typ zkumavky např. |
|
| Autoptické vyšetření |
detail |
| 22.4.2024 |
| |
ÚP |
ÚP *A |
biolog. materiál odebraný při pitvě
|
|
Poznámka: indikuje ošetř. lékař
Hodnocení:
1. makroskop. vyšetření - kvalitativní a kvantitativní změny tkání,
2. mikroskop. vyšetření - kvantitativní a kvalitativní změny tkání |
|
| Bioptické vyšetření |
detail |
| 22.4.2024 |
| BIO |
ÚP |
ÚP *A |
biolog.materiál pacienta odebraný při operaci, punkcí,endoskop.techn., ihned po odběru fixovaný 10% pufrovaným formolem |
|
Poznámka: indikuje ošetř. lékař
Hodnocení:
1. makroskop. vyšetření -kvalitativní a kvantitativní nenádor. i nádor. procesů,
2. mikroskop. vyšetření - kvalitativní a kvantitativní nenádor. i nádor. procesů |
|
| Cytologické vyšetření mozkomíšního moku |
detail |
| 22.4.2024 |
| |
ÚP |
ÚP *A |
Tělní tekutina získaná punkcí zpracovávána v režimu STATIM. |
Sterilní odběrový materiál, např. zkumavka bez protisrážlivých aditiv. |
Poznámka: NUTNO dodat ihned po odběru, netřepat, nemíchat.
Volat do laboratoře-l.8625
Hodnocení:makro-množství a vzhled
mikro-nenádorové procesy, nádorové procesy, etiol. agens |
|
| Cytologické vyšetření sputa |
detail |
| 22.4.2024 |
| |
ÚP |
ÚP *A |
Sputum získané expirací |
|
Poznámka: Po odběru uchovávat při teplotě 4-8C
Hodnocení: mikro-etiol. agens, nenádorové procesy, nádorové procesy |
|
| Cytologické vyšetření tělních tekutin |
detail |
| 22.4.2024 |
| |
ÚP |
ÚP *A |
Tělní tekutina získaná punkcí nebo výplachem |
|
Poznámka: Hodnocení: makro - množství a vzhled
mikro: nenádorové procesy, nádorové procesy, etiol. agens |
|
| Elektronmikr. vyš. |
detail |
| 22.4.2024 |
| |
ÚP |
ÚP |
Biolog.materiál pacienta
fixovaný a) 4% nebo 10% paraformaldehydem
b) 3% glutaraldehydem |
|
Poznámka: indikuje patolog
Hodnocení: na úrovni ultrastruktury
Informaci o fixaci event. fix. roztok na lince 8687 |
|
| Histochemické vyšetření |
detail |
| 22.4.2024 |
| |
ÚP |
ÚP |
Biologický materiál pacienta |
|
Poznámka: a) po odběru materiál namrazit v tekutém dusíku a přechovávat na suchém ledu
b) materiál vložit do zkumavky a v termosce s obyč.ledem transportovat na patol. pracoviště
Seznam cytologických a histologických základních a speciálních metod barvení viz. SM-PAT-02 Laboratorní příručka |
|
| Imunofluorescenční vyšetření |
detail |
| 22.4.2024 |
| |
ÚP |
ÚP *A |
tkáňový biologický materiál |
|
Poznámka: a) Materiál po odběru ihned zamrazit v tekutém dusíku, přechovávat na suchém ledu
b) Materiál po odběru vložit do zkumavky a okamžitě transportovat v termosce na obyčejném ledu
c) Je nutné dopředu dohodnout zpracování materiálu imunoflorescencí |
|
| Imunohistochemické vyšetření |
detail |
| 22.4.2024 |
| IHC |
ÚP |
ÚP *A |
Standardní materiál pro bioptické vyšetření, cytologický materiál zpracovaný jako cytoblok nebo cytospinový preparát. |
|
Poznámka: indikuje patolog
Hodnocení: kvalitativní, v některých případech i kvantitativní
Seznam protilátek používaných na ÚP k lokalizaci a vizualizaci tkáňových antigenů viz. SM-PAT-02 Laboratorní příručka
|
|
| Molekulárně patologická vyšetření |
detail |
| 22.4.2024 |
| LMP |
ÚP |
ÚP *A |
Standardní materiál pro bioptické vyšetření, tzn. standartně 10% pufrovaným formolem fixované do parafínu zalité tkáně (parafínový blok, nátěry, cytospiny a případně po domluvě i nativní tkáň a plasmu. |
|
Poznámka: LMP provádí následující vyšetření:
o prediktivních markerů: KRAS, NRAS, BRAF, EGFR (v případě EGFR z tkáně i plazmy), BRCA1,
BRCA2, KIT a PDGFRA (metodami NGS, qPCR či přímého Sangerova sekvenování)
o komplexní NGS analýzy DNA a RNA – somatické panely vybraných genů pro prediktivní či
diagnostické účely. V rámci DNA panelů se hodnotí mutace, CNV a MSI; nadto TMB a HRD u
panelu 360 genů/951 kbp kódující sekvence. V rámci RNA panelů se hodnotí fúze
(prognostické či diferenciálně diagnostické genové fúze charakteristické pro sarkomy a
prediktivní fúze zahrnující včetně např. ALK, ROS1, RET, NTRK1, NTRK2, NTRK3 atd.).
Použité NGS panely zahrnují stanovené aktuálně platné minimum vyšetřovaných genů.
o cytogenetických změn pomocí metody FISH: prediktivní markery – numerické změny genu HER2,
MET, zlomy genu ALK, a ROS1, NTRK1/2/3; dále translokace t(11;14) (q13;q32), t(14;18)
(q32;q21), t(11;18), t(8;14))q24;... |
|